Rozpoczęcie i zakończenie stosowania ulgi na innowacyjnych pracowników – zmiana stanowiska KIS
Tak wynika z najnowszych interpretacji KIS, m.in. z 5.01.2026 r. (0111-KDIB1-3.4010.607.2025.2.MBD), 6.11.2025 r. (0111-KDIB1-3.4010.518.2025.2.MBD) i 30.10.2025 r. (0114-KDIP2-1.4010.506.2025.1.MR1). Wcześniej organ zajmował odwrotne stanowisko.
Ulga na innowacyjnych pracowników (dalej ulga IP) jest uregulowana w art. 18db updop i art. 26eb updof. Polega na częściowym zwolnieniu podatnika z obowiązku wpłaty do US podatku dochodowego pobranego z wynagrodzeń takich pracowników. Uprawnia bowiem do pomniejszenia zaliczek na PIT (lub zryczałtowanego podatku), które podatnik (CIT lub PIT) prowadzący działalność B+R – jako płatnik – ma obowiązek przekazać do US, o kwotę stanowiącą iloczyn nieodliczonej w ramach ulgi B+R kwoty kosztów kwalifikowanych i stawki podatku dochodowego obowiązującej podatnika w roku korzystania z ulgi.
W myśl przepisów uprawnienie do pomniejszenia zaliczki/zryczałtowanego podatku przysługuje od miesiąca następującego bezpośrednio po miesiącu, w którym podatnik złożył zeznanie roczne, do końca roku podatkowego, w którym zostało złożone to zeznanie (art. 18db ust. 4 updop, art. 26eb ust. 4 updof).
Powstał problem, od kiedy do kiedy faktycznie podatnik może skorzystać z ulgi. Czy pomniejszeniu w danym roku:
• po raz pierwszy – podlega zaliczka/zryczałtowany podatek pobrane za miesiąc następny po miesiącu złożenia zeznania, czy przekazywane do US w tym miesiącu (następnym po miesiącu złożenia zeznania),
• po raz ostatni – podlega zaliczka/zryczałtowany podatek pobrane za ostatni miesiąc roku podatkowego, w którym podatnik złożył zeznanie, czy przekazywane do US w tym miesiącu.
Do niedawna KIS twierdziła, że istotne jest, kiedy pobrano zaliczkę/zryczałtowany podatek, a nie okres, za który zostały pobrane, czy też termin, z upływem którego podatnik jest obowiązany do odprowadzenia ich do US (por. np. interpretacje z 13.07.2023 r., 0114-KDIP2-1.4010.297.2023.2.MR1, 10.10.2024 r., 0114-KDIP2-1.4010.502.2024.1.MR1, 5.11.2024 r., 0111-KDIB1-3.4010.573.2024.1.JKU, 11.02.2025 r., 0114-KDIP2-1.4010.672.2024.1.MR1, i 3.03.2025 r., 0111-KDIB1-3.4010.71.2025.1.MBD). Przykładowo, podatnik CIT z rokiem podatkowym równym kalendarzowemu, który złożył CIT-8 w marcu 2026 r., mógłby w tym roku po raz pierwszy skorzystać z ulgi w odniesieniu do zaliczek na PIT pobranych w kwietniu, a przekazywanych do US w maju 2026 r., po raz ostatni zaś w stosunku do zaliczek pobranych w grudniu 2026 r., a wpłaconych do US w styczniu 2027 r.
Z najnowszych interpretacji KIS wynika jednak, że kluczowy jest moment wpłaty pobranych zaliczek do US (patrz ramka). Pomniejszeniu w 2026 r. podlega więc po raz pierwszy zaliczka na PIT pobrana w marcu od wypłaconych w tym miesiącu wynagrodzeń, a podlegająca przekazaniu do US w kwietniu, po raz ostatni zaś zaliczka pobrana w listopadzie od wynagrodzeń wypłaconych w tym miesiącu, a podlegająca wpłacie do US w grudniu 2026 r.
W praktyce różnica między stanowiskami KIS sprowadza się do przesunięcia (o miesiąc wcześniej) momentu rozpoczęcia/zakończenia korzystania z ulgi.
Moment skorzystania z ulgi na innowacyjnych pracowników – fragment interpretacji KIS z 5.01.2026 r.
Z treści art. 18db ust. 1 updop wynika, że podatnik będący płatnikiem (…) może pomniejszyć kwotę podlegających przekazaniu na rachunek US zaliczek na (…) PIT. Należy zauważyć, że przepisy art. 18db updop nie odwołują się w swoim brzmieniu bezpośrednio do takich kategorii jak „miesiąc, za który wynagrodzenie pracownika jest należne”, czy też „miesiąc, za który pobrano zaliczkę na podatek od pracownika”. (…) Prawo do odliczenia ulgi na innowacyjnych pracowników będzie przysługiwało w odniesieniu do zaliczek na PIT począwszy od miesiąca następującego po miesiącu, w którym podatnik złoży zeznanie roczne, tj. w stosunku do zaliczek na podatek dochodowy od osób fizycznych podlegających wpłacie do US w miesiącu następującym bezpośrednio po miesiącu złożenia zeznania CIT.
Skróty w artykułach
- dyrektywa 112 – dyrektywa Rady 2006/112/WE z 28.11.2006 r. w sprawie wspólnego systemu podatku od wartości dodanej (DzUrz UE L 347 z 11.12.2006 r.)
- dyrektywa 2013/34/UE – dyrektywa Parlamentu Europejskiego i Rady 2013/34/UE z 26.06.2013 r. w sprawie rocznych sprawozdań finansowych, skonsolidowanych sprawozdań finansowych i powiązanych sprawozdań niektórych rodzajów jednostek (...) (DzUrz UE L 182 z 29.06.2013 r.)
- Kc – ustawa z 23.04.1964 r. Kodeks cywilny (DzU z 2023 r. poz. 1610)
- KIMSF – interpretacje Komitetu ds. Interpretacji Międzynarodowej Sprawozdawczości Finansowej
- Kks – ustawa z 10.09.1999 r. Kodeks karny skarbowy (DzU z 2023 r. poz. 654)
- Kp – ustawa z 26.06.1974 r. Kodeks pracy (DzU z 2023 r. poz. 1465)
- Kpc – ustawa z 17.11.1964 r. Kodeks postępowania cywilnego (DzU z 2023 r. poz. 1550)
- Ksh – ustawa z 15.09.2000 r. Kodeks spółek handlowych (DzU z 2022 r. poz. 1467)
- KSR – Krajowe Standardy Rachunkowości
- MSR – Międzynarodowe Standardy Rachunkowości (ang. International Accounting Standards) wydawane od 2002 r. jako MSSF
- MSSF – Międzynarodowe Standardy Sprawozdawczości Finansowej (ang. International Financial Reporting Standards)
- Op – ustawa z 29.08.1997 r. Ordynacja podatkowa (DzU z 2023 r. poz. 2383)
- Ppsa – ustawa z 30.08.2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (DzU z 2023 r. poz. 1634)
- rozporządzenie o instrumentach finansowych – rozporządzenie Ministra Finansów z 12.12.2001 r. w sprawie szczegółowych zasad uznawania, metod wyceny, zakresu ujawniania i sposobu prezentacji instrumentów finansowych (DzU z 2017 r. poz. 277)
- rozporządzenie o konsolidacji – rozporządzenie Ministra Finansów z 25.09.2009 r. w sprawie szczegółowych zasad sporządzania przez jednostki inne niż banki, zakłady ubezpieczeń i zakłady reasekuracji skonsolidowanych sprawozdań finansowych grup kapitałowych (DzU z 2017 r. poz. 676)
- rozporządzenie składkowe – rozporządzenie Ministra Pracy i Polityki Socjalnej z 18.12.1998 r. w sprawie szczegółowych zasad ustalania podstawy wymiaru składek na ubezpieczenia emerytalne i rentowe (DzU z 2023 r. poz. 728)
- rozporządzenie z 13.09.2017 r. – rozporządzenie Ministra Rozwoju i Finansów w sprawie rachunkowości oraz planów kont dla budżetu państwa, budżetów jednostek samorządu terytorialnego, jednostek budżetowych, samorządowych zakładów budżetowych, państwowych funduszy celowych oraz państwowych jednostek budżetowych mających siedzibę poza granicami Rzeczypospolitej Polskiej (DzU z 2020 r. poz. 342)
- specustawa – ustawa z 2.03.2020 r. o szczególnych rozwiązaniach związanych z zapobieganiem, przeciwdziałaniem i zwalczaniem COVID-19, innych chorób zakaźnych oraz wywołanych nimi sytuacji kryzysowych (tekst jedn. DzU z 2023 r. poz. 1327)
- uobr – ustawa z 11.05.2017 r. o biegłych rewidentach, firmach audytorskich oraz nadzorze publicznym (DzU z 2023 r. poz. 1015)
- uor – ustawa z 29.09.1994 r. o rachunkowości (DzU z 2023 r. poz. 120)
- updof – ustawa z 26.07.1991 r. o podatku dochodowym od osób fizycznych (DzU z 2022 r. poz. 2647)
- updop – ustawa z 15.02.1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych (DzU z 2022 r. poz. 2587)
- upol – ustawa z 12.01.1991 r. o podatkach i opłatach lokalnych (DzU z 2023 r. poz. 70)
- US GAAP – Amerykańskie Standardy Rachunkowości (ang. Generally Accepted Accounting Principles)
- ustawa akcyzowa – ustawa z 6.12.2008 r. o podatku akcyzowym (DzU z 2023 r. poz. 1542)
- ustawa emerytalna – ustawa z 17.12.1998 r. o emeryturach i rentach z Funduszu Ubezpieczeń Społecznych (DzU z 2023 r. poz. 1251)
- ustawa KAS – ustawa z 16.11.2016 r. o Krajowej Administracji Skarbowej (DzU z 2023 r. poz. 615)
- ustawa o KRS – ustawa z 20.08.1997 r. o Krajowym Rejestrze Sądowym (DzU z 2023 r. poz. 685)
- ustawa o PCC – ustawa z 9.09.2000 r. o podatku od czynności cywilnoprawnych (DzU z z 2023 r. poz. 170)
- ustawa o VAT – ustawa z 11.03.2004 r. o podatku od towarów i usług (DzU z 2023 r. poz. 1570)
- ustawa o zfśs – ustawa z 4.03.1994 r. o zakładowym funduszu świadczeń socjalnych (DzU z 2023 r. poz. 998)
- ustawa zasiłkowa – ustawa z 25.06.1999 r. o świadczeniach pieniężnych z ubezpieczenia społecznego w razie choroby i macierzyństwa (DzU z 2022 r. poz. 1732)
- ustawa zdrowotna – ustawa z 27.08.2004 r. o świadczeniach opieki zdrowotnej finansowanych ze środków publicznych (DzU z 2022 r. poz. 2561)
- usus – ustawa z 13.10.1998 r. o systemie ubezpieczeń społecznych (DzU z 2023 r. poz. 1230)
- uzpd – ustawa o zryczałtowanym podatku dochodowym od niektórych przychodów osiąganych przez osoby fizyczne
- Założenia koncepcyjne MSSF – Założenia koncepcyjne sprawozdawczości finansowej (Conceptual Framework for Financial Reporting)
- CEIDG – Centralna Ewidencja i Informacja o Działalności Gospodarczej
- EOG – Europejski Obszar Gospodarczy
- FEP – Fundusz Emerytur Pomostowych
- FGŚP – Fundusz Gwarantowanych Świadczeń Pracowniczych
- FP – Fundusz Pracy
- FS – Fundusz Solidarnościowy
- IASB – Rada Międzynarodowych Standardów Rachunkowości
- IS – izba skarbowa
- KAS – Krajowa Administracja Skarbowa
- KIS – Krajowa Informacja Skarbowa
- KNF – Komisja Nadzoru Finansowego
- KRBR – Krajowa Rada Biegłych Rewidentów
- KRS – Krajowy Rejestr Sądowy
- KSB – Krajowe Standardy Badania
- MF – Minister Finansów
- MPiPS – Minister Pracy i Polityki Społecznej
- MRiF – Minister Rozwoju i Finansów
- MRiPS – Minister Rodziny i Polityki Społecznej
- MSiG – Monitor Sądowy i Gospodarczy
- NSA – Naczelny Sąd Administracyjny
- PANA – Polska Agencja Nadzoru Audytowego
- PIBR – Polska Izba Biegłych Rewidentów
- PKD – Polska Klasyfikacja Działalności
- pkpir – podatkowa księga przychodów i rozchodów
- PPK – pracownicze plany kapitałowe
- RM – Rada Ministrów
- SA – sąd apelacyjny
- sf – sprawozdanie finansowe
- skok – spółdzielcza kasa oszczędnościowo-kredytowa
- SN – Sąd Najwyższy
- SO – sąd okręgowy
- TK – Trybunał Konstytucyjny
- TSUE – Trybunał Sprawiedliwości Unii Europejskiej
- UCS – urząd celno-skarbowy
- UE – Unia Europejska
- US – urząd skarbowy
- WDT – wewnątrzwspólnotowa dostawa towarów
- WNT – wewnątrzwspólnotowe nabycie towarów
- WSA – wojewódzki sąd administracyjny
- zfśs – zakładowy fundusz świadczeń socjalnych