Jakie oprocentowanie, gdy organ niesłusznie zakwestionował zwrot VAT

Tak wynika z wyroku NSA z 26.02.2025 r. (I FSK 1611/21).

Zgodnie z art. 87 ust. 2 ustawy o VAT podstawowy termin zwrotu VAT może być przedłużony do czasu zakończenia weryfikacji rozliczenia podatnika dokonywanej w ramach czynności sprawdzających, kontroli podatkowej, kontroli celno-skarbowej lub postępowania podatkowego – jeżeli zasadność zwrotu wymaga dodatkowego zweryfikowania. Gdy weryfikacja przeprowadzona przez US potwierdzi zasadność zwrotu, podatnikowi przysługują też odsetki – w wysokości odpowiadającej opłacie prolongacyjnej stosowanej w przypadku odroczenia płatności podatku lub jej rozłożenia na raty.

Organy podatkowe i sądy administracyjne przyjmowały dotychczas, że w razie wniesienia przez podatnika odwołania od decyzji w sprawie weryfikacji zwrotu VAT, dopóki nie zakończył się spór podatnika z organami podatkowymi, dopóty wraz z należnym, ale opóźnionym zwrotem, przysługiwało mu oprocentowanie w wysokości opłaty prolongacyjnej.

Zakwestionował to NSA. Odwołując się do swoich wcześniejszych orzeczeń (z 15.05.2023 r., I FSK 1371/20, i 28.09.2023 r., I FSK 582/23), stwierdził, że z art. 87 ust. 2 ustawy o VAT wynika, że zwrot VAT wiąże się z wypłatą odsetek odpowiadających opłacie prolongacyjnej pod warunkiem przedłużenia terminu zwrotu z uwagi na jego weryfikację w odpowiednim trybie, do czasu zakończenia weryfikacji w ramach tego trybu oraz pozytywnej weryfikacji zwrotu.

NSA podzielił zarzuty skargi kasacyjnej, że tylko naczelnik US może przedłużyć zwrot, a więc to jego czynności dotyczy art. 87 ust. 2 ustawy o VAT. Z kolei „zakończenie weryfikacji rozliczenia” należy rozumieć jako zakończenie weryfikacji w ramach art. 87 ust. 2 ustawy o VAT, tj. zakończenie odpowiednio procedur – czynności sprawdzających, kontroli podatkowej, kontroli celno-skarbowej lub postępowania podatkowego. Jeżeli weryfikacja zwrotu wiąże się z przeprowadzaniem postępowania podatkowego, końcem tej weryfikacji jest umorzenie postępowania albo wydanie decyzji wymiarowej.

W ocenie NSA zainicjowane przez stronę postępowanie odwoławcze i przeprowadzone następnie postępowanie sądowe nie są kontynuacją postępowania weryfikacyjnego, o którym mowa w art. 87 ust. 2 ustawy o VAT.

Do okresu postępowania przed organem odwoławczym i później przed sądami administracyjnymi, a także do okresu ew. ponownego prowadzenia sprawy przez organ I instancji, w ocenie NSA ma zastosowanie art. 87 ust. 7 ustawy o VAT, a więc za ten okres, oprócz zwrotu VAT, podatnikowi należy się oprocentowanie jak od nadpłaty.